Pracownia Chemii Biologicznej (P33)
OPIS PRACOWNI
Pracownia Chemii biologicznej zlokalizowana na Wydziale Chemii UJ jest jednostką zajmującą się prowadzeniem interdyscyplinarnych zajęć dydaktycznych z pogranicza chemii, biochemii, farmacji i medycyny. Prowadzone zajęcia dydaktyczne oraz badania naukowe w ramach prac magisterskich i doktorskich związane są głównie z oddziaływaniem ligandów lub potencjalnych leków, czy środków diagnostycznych z makrocząsteczkami (głównie białko i DNA). Temat ten jest rozwijany wielokierunkowo i obejmuje syntezę odpowiednich związków, ich oddziaływanie z cząsteczkami biologicznymi, a także ich wpływ na komórki. Badania fizykochemiczne prowadzone są przy wykorzystaniu szeregu technik spektroskopowych, chromatograficznych oraz elektrochemicznych. Z kolei badania krystalograficzne obejmują analizę strukturalną zarówno białek, jak i potencjalnych ligandów, a w niektórych przypadkach utworzonych adduktów. Pomiary wykonywane są w szerokim zakresie temperatur i ciśnień. Innym obszarem badawczym Pracowni jest wykorzystanie związków makrocyklicznych w terapii fotodynamicznej (PDT). Właściwości fotochemiczne i fotofizyczne związków są badane z wykorzystaniem fotolizy laserowej oraz układów do naświetlań ciągłych. Pracownicy dydaktyczno-naukowi Pracowni Chemii Biologicznej (2 profesorów, 4 adiunktów i 2 asystentów) prowadzą zajęcia dydaktyczne m.in. w ramach:
- modułu Chemia organiczna i biologiczna (kierunek: chemia, I stopień studiów),
- panelu Chemia biologiczna (kierunek: chemia, II stopień studiów),
- kursu Krystalochemia białek (kierunek: biofizyka, I stopień studiów)
- prac licencjackich (kierunek: chemia, I stopień studiów),
- prac magisterskich (kierunek: chemia, II stopień studiów),
- prac doktorskich (kierunek: chemia, III stopień studiów).
Absolwenci panelu Chemia biologiczna, wykonujący swe prace m.in. w Pracowni Chemii Biologicznej, znajdują zatrudnienie na stanowiskach związanych ze zdobytym doświadczeniem i umiejętnościami w firmach farmaceutycznych i laboratoriach kontroli jakości. Ze względu na swoje interdyscyplinarne wykształcenie są również cenionymi pracownikami w laboratoriach zajmujących się analizą próbek biologicznych, czy też w firmach przeprowadzających badania kliniczne.
APARATURA ZAKUPIONA W RAMACH PROJEKTU
| L.p. | Nazwa | Krótki | Zdjęcie |
| 1 | HPLC z systemem oczyszczania | Wysokosprawny chromatograf cieczowy (HPLC) Perkin Elmer Flexar wyposażony jest w detektor UV-Vis (190-700 nm), pompę gradientową umożliwiającą tworzenie gradientu od 0 do 100% dla czterech składników, system do odgazowania eluentów oraz manualny system dozowania. Aparat służy do wykonywania oznaczeń analitycznych, a wybrana konfiguracja umożliwia szeroki zakres doboru metod rozdziału. Sterowany jest z poziomu komputera i wyposażony jest w oprogramowanie umożliwiające akwizycję, obróbkę i wizualizację danych. System do oczyszczania wody (Hydrolab) jest wykorzystywany do przygotowania roztworów eluentów | |
| 2 | Aparatura stopped-flow z wyposażeniem | Spektrofluorymetr stopped-flow Applied Photophysics SX20 z detektorem UV-vis (absorpcyjny i fluorescencyjny) umożliwiający badania w zakresie kilku ms do15. Zmienne ustawienie komory pomiarowej pozwala na wybór długości drogi optycznej (2 lub 10 mm). Komora jest termostatowana przy użyciu zewnętrznego termostatu cyrkulacyjnego firmy PolyScience 9006. Aparat wyposażony jest w monitor i komputer z zainstalowanym systemem sterującym, zbierającym i analizującym dane. Dodatkowe wyposażenie do przygotowania próbek: pipety automatyczne (Ependorf), pHmetr (Elmetron), waga techniczna i analityczna (Radwag), lodówka (Snajge), wirówka (Thermo Scientific), mieszadło magnetyczne (Thermo Scientific) | |
| 3 | Zestaw do elektroforezy pionowej z systemem dokumentacji obrazu oraz wyposażeniem do przygotowania próbek | W skład zestawu wchodzą: aparat MiniProtean Tetra Cell do pionowej elektroforezy białek z zasilaczem PowerPac Basic Power Supply (Bio-Rad) oraz system dokumentacji obrazu MINIPRO z wbudowanym transiluminatorem, system ze zintegrowaną kamerą CCD wbudowaną w ciemnię z kolorowym wyświetlaczem, filtrem UV (firmy DNR) wraz z komputerem sterującym i oprogramowaniem. Dodatkowe wyposażenie: pipety automatyczne (Ependorf), mieszadło magnetyczne (Thermo Scientific), termoblok (Grant) | |
| 4 | Spektrofotometr UV-Vis dwuwiązkowy z przystawką kinetyczną | Spektrofotometr UV-Vis Perkin Elmer Lambda 35 dwuwiązkowy z monochromatorem z holograficzną siatką dyfrakcyjną (zakres długości fal 190-1100 nm), z przystawką do termostatowania (system Pletiera, 0-110 °C) i 6 pozycyjnym automatycznym zmieniaczem kuwet. Sterowny z poziomu notebooka (Lenovo ThinkPad) i wyposażony w oprogramowanie umożliwiające akwizycję, obróbkę i wizualizację danych | |
| 5 | Spektrofluorymetr z wyposażeniem | Spektrofluorymetr Perkin Elmer LS55, wzbudzany impulsową lampą ksenonową do pomiarów fluorescencji, fosforescencji, chemiluminescencji i bioluminescencji (wzbudzenie: 200-800 nm, emisja 200-900 nm) sterowny z poziomu notebooka (Lenovo) i wyposażony w oprogramowanie umożliwiające akwizycję, obróbkę i wizualizację danych, wyposażony w termostatowany uchwyt na kuwety połączony z zewnętrznym termostatem cyrkulacyjnym firmy PolyScience 9006. Dodatkowe wyposażenie do przygotowania próbek: pipety automatyczne(Eppendorf), wytrząsarka (IKA), homogenizator mechaniczny X 120 (Alchem) | |
| 6 | Spektrofotometr UV-Vis z dektorem | Spektrometr Perkin Elmer Lambda BIO PLUS z wbudowanym oprogramowaniem zapewniającym pełną kontrolę aparatu, budowanie metod i ich przechowywanie, z wbudowaną drukarką, z detektorem CCD (zakres pomiarów 200-950 nm), wyposażony w notebook (Lenovo ThinkPad) | |
| 7 | Mikroskop polaryzacyjny stereoskopowy | Stereoskopowy mikroskop polaryzacyjny Conbest K-700 (CCD-0.65x), powiększenie zoom od 7,5 do 50x, głowica obrotowa 360°, trinokular, kąt 35°, oświetlenie górno-boczne i dolne z regulacją intensywności, okular mikrometryczny (WF-10x/10mm:0,1), pierścień z oświetleniem z zestawem do rejestracji obrazu i kamerą CCD 3.0 MegaPix | |
ZAJĘCIA DYDAKTYCZNE PROWADZONE Z WYKORZYSTANIEM ZAKUPIONEJ APARATURY
| L.p. | Nazwa | Nazwa | Kierunek |
| 1 | HPLC z systemem oczyszczania | Pracownia specjalizacyjna panelu Chemia biologiczna | kierunek: chemia, |
| Realizacja prac doktorskich i magisterskich | kierunek: chemia, | ||
| 2 | Aparatura stopped-flow z wyposażeniem | Pracownia specjalizacyjna panelu Chemia biologiczna | kierunek: chemia, |
| Pracownia specjalizacyjna panelu Chemia koordynacyjna | kierunek: chemia, | ||
| Realizacja prac doktorskich i magisterskich | kierunek: chemia, | ||
| 3 | Zestaw do elektroforezy pionowej z systemem dokumentacji obrazu oraz wyposażeniem do przygotowania próbek | Chemia biologiczna – laboratorium | kierunek: chemia, |
| Pracownia specjalizacyjna panelu Chemia biologiczna | kierunek: chemia, | ||
| Realizacja prac doktorskich i magisterskich | kierunek: chemia, | ||
| 4 | Spektrofotometr UV-Vis dwuwiązkowy z przystawką kinetyczną | Pracownia specjalizacyjna panelu Chemia biologiczna | kierunek: chemia, |
| Chemia biologiczna – laboratorium | kierunek: chemia, | ||
| Realizacja prac doktorskich, magisterskich i licencjackich | kierunek: chemia, | ||
| 5 | Spektrofluorymetr z wyposażeniem | Pracownia specjalizacyjna panelu Chemia biologiczna | kierunek: chemia, |
| Chemia biologiczna – laboratorium | kierunek: chemia, | ||
| Analiza instrumentalna w ochronie środowiska I WCh-OLo315A-05 | kierunek: ochrona środowiska, | ||
| Realizacja prac magisterskich i doktorskich | kierunek: chemia, | ||
| 6 | Spektrofotometr UV-Vis z detektorem diode array | Pracownia specjalizacyjna panelu Chemia biologiczna | kierunek: chemia, |
| Realizacja prac magisterskich i doktorskich | kierunek: chemia, | ||
| Chemia biologiczna – laboratorium | kierunek: chemia, | ||
| 7 | Mikroskop polaryzacyjny stereoskopowy | Pracownia specjalizacyjna panelu Chemia biologiczna | kierunek: chemia, |
| Krystalochemia białek | kierunek: biofizyka, | ||
| Realizacja prac magisterskich i doktorskich | kierunek: chemia, |